Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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