Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNB3Q15768 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNB3Q15768 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFNB3Q15768 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNB3Q15768 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNB3Q15768 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNB3Q15768 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFNB3Q15768 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNB3Q15768 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB3Q15768 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms