Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYTH1Q15438 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYTH1Q15438 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYTH1Q15438 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYTH1Q15438 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYTH1Q15438 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYTH1Q15438 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYTH1Q15438 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYTH1Q15438 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYTH1Q15438 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYTH1Q15438 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYTH1Q15438 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYTH1Q15438 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYTH1Q15438 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYTH1Q15438 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYTH1Q15438 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYTH1Q15438 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYTH1Q15438 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYTH1Q15438 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH1Q15438 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYTH1Q15438 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms