Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms