Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCEQ15113 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCOLCEQ15113 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCOLCEQ15113 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCOLCEQ15113 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCOLCEQ15113 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCOLCEQ15113 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCOLCEQ15113 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCOLCEQ15113 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCOLCEQ15113 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCOLCEQ15113 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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