Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCA4Q14CN2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCA4Q14CN2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCA4Q14CN2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCA4Q14CN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCA4Q14CN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCA4Q14CN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCA4Q14CN2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCA4Q14CN2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCA4Q14CN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCA4Q14CN2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCA4Q14CN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCA4Q14CN2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCA4Q14CN2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCA4Q14CN2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCA4Q14CN2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCA4Q14CN2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCA4Q14CN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCA4Q14CN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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