Protein–RNA interactions for Protein: Q14749

GNMT, Glycine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNMTQ14749 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GNMTQ14749 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNMTQ14749 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNMTQ14749 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNMTQ14749 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNMTQ14749 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNMTQ14749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNMTQ14749 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNMTQ14749 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNMTQ14749 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNMTQ14749 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNMTQ14749 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNMTQ14749 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNMTQ14749 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNMTQ14749 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNMTQ14749 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNMTQ14749 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNMTQ14749 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNMTQ14749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms