Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBRQ14739 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LBRQ14739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBRQ14739 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBRQ14739 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBRQ14739 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LBRQ14739 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LBRQ14739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBRQ14739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LBRQ14739 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LBRQ14739 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LBRQ14739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LBRQ14739 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LBRQ14739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LBRQ14739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LBRQ14739 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LBRQ14739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LBRQ14739 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LBRQ14739 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LBRQ14739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LBRQ14739 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBRQ14739 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBRQ14739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LBRQ14739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBRQ14739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBRQ14739 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBRQ14739 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBRQ14739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBRQ14739 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBRQ14739 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBRQ14739 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBRQ14739 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBRQ14739 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBRQ14739 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBRQ14739 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBRQ14739 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBRQ14739 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LBRQ14739 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LBRQ14739 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBRQ14739 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBRQ14739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBRQ14739 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBRQ14739 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LBRQ14739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBRQ14739 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LBRQ14739 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LBRQ14739 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LBRQ14739 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBRQ14739 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBRQ14739 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBRQ14739 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LBRQ14739 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBRQ14739 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBRQ14739 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBRQ14739 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBRQ14739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBRQ14739 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBRQ14739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBRQ14739 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBRQ14739 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LBRQ14739 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LBRQ14739 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBRQ14739 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBRQ14739 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LBRQ14739 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LBRQ14739 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBRQ14739 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBRQ14739 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBRQ14739 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LBRQ14739 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LBRQ14739 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LBRQ14739 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LBRQ14739 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBRQ14739 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBRQ14739 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LBRQ14739 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LBRQ14739 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBRQ14739 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBRQ14739 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBRQ14739 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBRQ14739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBRQ14739 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBRQ14739 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms