Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTAN1Q13813 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTAN1Q13813 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTAN1Q13813 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTAN1Q13813 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTAN1Q13813 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTAN1Q13813 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTAN1Q13813 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTAN1Q13813 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTAN1Q13813 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTAN1Q13813 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTAN1Q13813 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTAN1Q13813 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPTAN1Q13813 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTAN1Q13813 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTAN1Q13813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTAN1Q13813 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTAN1Q13813 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTAN1Q13813 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTAN1Q13813 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTAN1Q13813 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTAN1Q13813 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTAN1Q13813 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTAN1Q13813 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTAN1Q13813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTAN1Q13813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTAN1Q13813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTAN1Q13813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTAN1Q13813 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTAN1Q13813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTAN1Q13813 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTAN1Q13813 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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