Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB3Q13751 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB3Q13751 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB3Q13751 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB3Q13751 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB3Q13751 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB3Q13751 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAMB3Q13751 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMB3Q13751 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB3Q13751 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB3Q13751 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB3Q13751 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB3Q13751 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB3Q13751 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB3Q13751 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB3Q13751 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB3Q13751 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB3Q13751 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMB3Q13751 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LAMB3Q13751 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMB3Q13751 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB3Q13751 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB3Q13751 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB3Q13751 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB3Q13751 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB3Q13751 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB3Q13751 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB3Q13751 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB3Q13751 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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