Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMK2DQ13557 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAMK2DQ13557 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAMK2DQ13557 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMK2DQ13557 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMK2DQ13557 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMK2DQ13557 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMK2DQ13557 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMK2DQ13557 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMK2DQ13557 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMK2DQ13557 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMK2DQ13557 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMK2DQ13557 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMK2DQ13557 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMK2DQ13557 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMK2DQ13557 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMK2DQ13557 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMK2DQ13557 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMK2DQ13557 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMK2DQ13557 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMK2DQ13557 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms