Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SERINC3Q13530 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SERINC3Q13530 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SERINC3Q13530 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERINC3Q13530 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SERINC3Q13530 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SERINC3Q13530 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SERINC3Q13530 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERINC3Q13530 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SERINC3Q13530 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SERINC3Q13530 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SERINC3Q13530 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERINC3Q13530 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SERINC3Q13530 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SERINC3Q13530 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERINC3Q13530 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERINC3Q13530 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERINC3Q13530 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERINC3Q13530 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SERINC3Q13530 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERINC3Q13530 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERINC3Q13530 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERINC3Q13530 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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