Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GPM6BQ13491 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPM6BQ13491 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPM6BQ13491 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GPM6BQ13491 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPM6BQ13491 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPM6BQ13491 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GPM6BQ13491 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GPM6BQ13491 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GPM6BQ13491 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GPM6BQ13491 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GPM6BQ13491 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPM6BQ13491 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPM6BQ13491 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPM6BQ13491 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPM6BQ13491 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPM6BQ13491 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPM6BQ13491 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GPM6BQ13491 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPM6BQ13491 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GPM6BQ13491 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPM6BQ13491 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPM6BQ13491 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPM6BQ13491 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPM6BQ13491 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPM6BQ13491 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPM6BQ13491 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GPM6BQ13491 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPM6BQ13491 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPM6BQ13491 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPM6BQ13491 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPM6BQ13491 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPM6BQ13491 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPM6BQ13491 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPM6BQ13491 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPM6BQ13491 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms