Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXE3Q13461 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXE3Q13461 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXE3Q13461 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXE3Q13461 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXE3Q13461 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXE3Q13461 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXE3Q13461 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXE3Q13461 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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