Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LSAMPQ13449 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSAMPQ13449 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSAMPQ13449 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSAMPQ13449 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSAMPQ13449 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSAMPQ13449 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSAMPQ13449 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSAMPQ13449 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSAMPQ13449 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSAMPQ13449 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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