Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DYNC1I2Q13409 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DYNC1I2Q13409 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I2Q13409 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I2Q13409 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I2Q13409 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1I2Q13409 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I2Q13409 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I2Q13409 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I2Q13409 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1I2Q13409 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1I2Q13409 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1I2Q13409 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DYNC1I2Q13409 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DYNC1I2Q13409 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1I2Q13409 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DYNC1I2Q13409 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1I2Q13409 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I2Q13409 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I2Q13409 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I2Q13409 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I2Q13409 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I2Q13409 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I2Q13409 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I2Q13409 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1I2Q13409 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms