Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATMQ13315 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATMQ13315 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATMQ13315 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATMQ13315 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATMQ13315 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATMQ13315 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATMQ13315 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATMQ13315 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATMQ13315 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATMQ13315 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATMQ13315 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATMQ13315 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATMQ13315 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATMQ13315 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATMQ13315 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATMQ13315 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATMQ13315 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATMQ13315 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATMQ13315 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATMQ13315 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATMQ13315 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATMQ13315 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATMQ13315 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATMQ13315 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATMQ13315 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATMQ13315 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATMQ13315 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATMQ13315 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATMQ13315 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATMQ13315 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATMQ13315 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATMQ13315 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATMQ13315 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATMQ13315 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATMQ13315 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATMQ13315 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATMQ13315 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATMQ13315 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATMQ13315 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATMQ13315 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATMQ13315 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATMQ13315 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATMQ13315 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATMQ13315 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATMQ13315 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMQ13315 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMQ13315 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMQ13315 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMQ13315 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMQ13315 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ATMQ13315 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMQ13315 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMQ13315 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMQ13315 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMQ13315 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMQ13315 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMQ13315 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMQ13315 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATMQ13315 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATMQ13315 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMQ13315 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMQ13315 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATMQ13315 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMQ13315 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMQ13315 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATMQ13315 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMQ13315 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMQ13315 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATMQ13315 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMQ13315 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATMQ13315 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATMQ13315 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMQ13315 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMQ13315 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMQ13315 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATMQ13315 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATMQ13315 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATMQ13315 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATMQ13315 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATMQ13315 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATMQ13315 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATMQ13315 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATMQ13315 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATMQ13315 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATMQ13315 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATMQ13315 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATMQ13315 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATMQ13315 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATMQ13315 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATMQ13315 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMQ13315 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMQ13315 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMQ13315 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATMQ13315 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATMQ13315 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATMQ13315 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATMQ13315 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATMQ13315 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATMQ13315 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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