Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-231ENST00000639853 1425 ntTSL 58.29□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 60.1
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TARDBPQ13148 ISL2-203ENST00000558656 1446 ntTSL 515.61■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 60
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TARDBPQ13148 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 59.8
TARDBPQ13148 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 59.8
TARDBPQ13148 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 59.8
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TARDBPQ13148 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.623e-14■■■■■ 59.4
TARDBPQ13148 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-14■■■■■ 59.4
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TARDBPQ13148 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 58
TARDBPQ13148 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 58
TARDBPQ13148 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 324.98■■□□□ 1.596e-7■■■■■ 57.9
TARDBPQ13148 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 57.9
TARDBPQ13148 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 57.9
TARDBPQ13148 PFKP-205ENST00000413079 496 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 57.5
TARDBPQ13148 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.744e-8■■■■■ 57.3
TARDBPQ13148 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 57.3
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TARDBPQ13148 UBE2A-201ENST00000346330 718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 57.3
TARDBPQ13148 UBE2A-209ENST00000629303 557 ntTSL 411.07□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 57.3
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TARDBPQ13148 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.289e-9■■■■■ 57.2
TARDBPQ13148 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 57.2
TARDBPQ13148 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 519.3■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 57.2
TARDBPQ13148 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 418.29■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 57.2
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TARDBPQ13148 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.646e-16■■■■■ 57
TARDBPQ13148 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.35□□□□□ -1.716e-16■■■■■ 57
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TARDBPQ13148 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 27.45□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 55.8
TARDBPQ13148 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.987e-11■■■■■ 55.6
TARDBPQ13148 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.922e-10■■■■■ 55.5
TARDBPQ13148 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.097e-10■■■■■ 55.4
TARDBPQ13148 ZNF767P-204ENST00000486492 1616 ntTSL 215.59■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 55.4
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TARDBPQ13148 ZNF767P-203ENST00000481762 357 ntTSL 38.35□□□□□ -1.077e-10■■■■■ 55.4
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TARDBPQ13148 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.476e-12■■■■■ 55.2
TARDBPQ13148 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-12■■■■■ 55.2
TARDBPQ13148 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.846e-12■■■■■ 55.2
TARDBPQ13148 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.676e-12■■■■■ 55.2
TARDBPQ13148 SRPK2-210ENST00000477925 1336 ntTSL 57.62□□□□□ -1.196e-13■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 SRPK2-207ENST00000466917 2565 ntTSL 27.53□□□□□ -1.26e-13■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 SRPK2-208ENST00000474770 872 ntTSL 34.83□□□□□ -1.646e-13■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 33.65□□□□□ -1.836e-13■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 SRPK2-205ENST00000465072 954 ntTSL 53.52□□□□□ -1.856e-13■■■■■ 55.1
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TARDBPQ13148 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 55.1
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TARDBPQ13148 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 413.37□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 513.2□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 55.1
TARDBPQ13148 PKP4-215ENST00000494945 522 ntTSL 510.25□□□□□ -0.772e-16■■■■■ 55
TARDBPQ13148 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 310.48□□□□□ -0.737e-17■■■■■ 55
TARDBPQ13148 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 54.6
TARDBPQ13148 C10orf128-204ENST00000374156 2070 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 54.4
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