Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BNIP1Q12981 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BNIP1Q12981 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BNIP1Q12981 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BNIP1Q12981 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BNIP1Q12981 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BNIP1Q12981 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BNIP1Q12981 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BNIP1Q12981 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BNIP1Q12981 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BNIP1Q12981 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BNIP1Q12981 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BNIP1Q12981 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BNIP1Q12981 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BNIP1Q12981 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BNIP1Q12981 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BNIP1Q12981 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BNIP1Q12981 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BNIP1Q12981 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BNIP1Q12981 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BNIP1Q12981 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BNIP1Q12981 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNIP1Q12981 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BNIP1Q12981 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BNIP1Q12981 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BNIP1Q12981 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP1Q12981 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP1Q12981 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP1Q12981 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP1Q12981 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP1Q12981 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BNIP1Q12981 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP1Q12981 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BNIP1Q12981 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNIP1Q12981 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP1Q12981 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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