Protein–RNA interactions for Protein: Q12870

TCF15, Transcription factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF15Q12870 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TCF15Q12870 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCF15Q12870 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCF15Q12870 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCF15Q12870 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCF15Q12870 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCF15Q12870 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCF15Q12870 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCF15Q12870 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TCF15Q12870 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCF15Q12870 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TCF15Q12870 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCF15Q12870 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCF15Q12870 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCF15Q12870 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCF15Q12870 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCF15Q12870 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TCF15Q12870 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF15Q12870 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF15Q12870 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCF15Q12870 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCF15Q12870 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCF15Q12870 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCF15Q12870 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TCF15Q12870 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCF15Q12870 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCF15Q12870 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TCF15Q12870 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCF15Q12870 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCF15Q12870 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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TCF15Q12870 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TCF15Q12870 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF15Q12870 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCF15Q12870 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF15Q12870 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF15Q12870 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCF15Q12870 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCF15Q12870 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF15Q12870 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF15Q12870 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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