Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 07e-10■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.197e-10■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.557e-10■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.037e-10■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.95□□□□□ -1.627e-10■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-205ENST00000536738 824 ntTSL 330.3■■■□□ 2.442e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.862e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.492e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-207ENST00000540129 1524 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-208ENST00000542726 587 ntTSL 215.44■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-206ENST00000537945 795 ntTSL 312.02□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-204ENST00000536602 1008 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 WSB2-210ENST00000543218 935 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 33.9
GRSF1Q12849 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.825e-19■■■■■ 33.8
GRSF1Q12849 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 33.4
GRSF1Q12849 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-13■■■■■ 33.2
GRSF1Q12849 QSOX1-204ENST00000443059 893 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-13■■■■■ 33.2
GRSF1Q12849 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-13■■■■■ 33.2
GRSF1Q12849 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.143e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 ZDHHC7-202ENST00000344861 2727 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 ZDHHC7-204ENST00000564526 603 ntTSL 216.06■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-201ENST00000346498 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 ZDHHC7-207ENST00000569377 608 ntTSL 211.39□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-203ENST00000517436 554 ntTSL 410.18□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-204ENST00000517673 607 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-205ENST00000518016 495 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.253e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 FBXO16-209ENST00000520481 598 ntTSL 35.42□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 33.1
GRSF1Q12849 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.443e-7■■■■■ 32.9
GRSF1Q12849 FKBP9-213ENST00000494374 1549 ntTSL 519.87■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 32.9
GRSF1Q12849 FKBP9-208ENST00000472007 703 ntTSL 312.93□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 32.9
GRSF1Q12849 FKBP9-203ENST00000463443 377 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 32.9
GRSF1Q12849 FKBP9-211ENST00000489038 781 ntTSL 310.04□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 32.9
GRSF1Q12849 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 32.8
GRSF1Q12849 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 318.78■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 32.8
GRSF1Q12849 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.347e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.347e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.667e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 29.91□□□□□ -0.827e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.847e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.97e-13■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 32.6
GRSF1Q12849 COL9A3-206ENST00000466532 539 ntTSL 220.49■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 32.5
GRSF1Q12849 CARD10-207ENST00000476871 583 ntTSL 421.25■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 32.4
GRSF1Q12849 CARD10-210ENST00000494166 560 ntTSL 521.25■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 32.4
GRSF1Q12849 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 32.4
GRSF1Q12849 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 32.2
GRSF1Q12849 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.117e-9■■■■■ 32
GRSF1Q12849 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.67e-9■■■■■ 32
GRSF1Q12849 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-9■■■■■ 31.9
GRSF1Q12849 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.131e-323■■■■■ 31.7
GRSF1Q12849 TMEM11-203ENST00000583264 819 ntTSL 220.36■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 TMEM11-206ENST00000584732 967 ntTSL 517.41■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 TMEM11-204ENST00000583929 827 ntTSL 315.8■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.072e-13■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.92e-13■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.382e-13■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 31.6
GRSF1Q12849 CPA6-202ENST00000479862 1494 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 31.5
GRSF1Q12849 CPA6-203ENST00000518549 1538 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 31.5
GRSF1Q12849 CPA6-204ENST00000638254 1870 ntTSL 511.16□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 31.5
GRSF1Q12849 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 31.5
GRSF1Q12849 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-13■■■■■ 31.4
GRSF1Q12849 MAT1A-203ENST00000480845 790 ntTSL 313.32□□□□□ -0.282e-17■■■■■ 31.2
GRSF1Q12849 MAT1A-204ENST00000485270 2661 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-17■■■■■ 31.2
GRSF1Q12849 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-17■■■■■ 31.2
GRSF1Q12849 CAD-207ENST00000475695 687 ntTSL 317.6■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 31
GRSF1Q12849 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 31
GRSF1Q12849 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 31
GRSF1Q12849 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 31
GRSF1Q12849 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 31
GRSF1Q12849 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.063e-12■■■■■ 30.9
GRSF1Q12849 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.156e-9■■■■■ 30.9
GRSF1Q12849 DCUN1D2-206ENST00000465710 460 ntTSL 313.84□□□□□ -0.194e-10■■■■■ 30.9
GRSF1Q12849 YWHAE-213ENST00000576854 1374 nt24.28■■□□□ 1.484e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.224e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.164e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 PPP1R37-204ENST00000540059 1719 ntTSL 221.75■■□□□ 1.074e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-210ENST00000571456 744 ntTSL 321.24■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-218ENST00000575207 575 ntTSL 418.11■□□□□ 0.494e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 PPP1R37-202ENST00000422370 5943 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 216.8■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 MARK4-203ENST00000587566 553 ntTSL 515.42■□□□□ 0.064e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-204ENST00000486241 691 ntTSL 215.37■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.234e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-205ENST00000489287 465 ntTSL 211.49□□□□□ -0.574e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-207ENST00000498643 312 ntTSL 310.47□□□□□ -0.734e-9■■■■■ 30.8
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