Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.86□□□□□ -0.67
TMA46Q12000 YLR235CYLR235C 399 nt10.86□□□□□ -0.67
TMA46Q12000 RAX1YOR301W 1308 nt10.85□□□□□ -0.67
TMA46Q12000 TIM23YNR017W 669 nt10.85□□□□□ -0.67
TMA46Q12000 CCA1YER168C 1641 nt10.84□□□□□ -0.67
TMA46Q12000 ANP1YEL036C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
TMA46Q12000 YLR179CYLR179C 606 nt10.82□□□□□ -0.68
TMA46Q12000 AQY1YPR192W 918 nt10.81□□□□□ -0.68
TMA46Q12000 STB1YNL309W 1263 nt10.8□□□□□ -0.68
TMA46Q12000 MCH5YOR306C 1566 nt10.8□□□□□ -0.68
TMA46Q12000 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.79□□□□□ -0.68
TMA46Q12000 HSP60YLR259C 1719 nt10.78□□□□□ -0.68
TMA46Q12000 SPC25YER018C 666 nt10.77□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 WSC2YNL283C 1512 nt10.76□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 YKL030WYKL030W 606 nt10.76□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 FEN2YCR028C 1539 nt10.74□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 FUR4YBR021W 1902 nt10.74□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 AHT1YHR093W 549 nt10.73□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 ALG12YNR030W 1656 nt10.72□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 VPS60YDR486C 690 nt10.71□□□□□ -0.69
TMA46Q12000 GPI16YHR188C 1833 nt10.7□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 MIC12YBR262C 321 nt10.7□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 GLK1YCL040W 1503 nt10.69□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 BNA2YJR078W 1362 nt10.69□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 CCT4YDL143W 1587 nt10.69□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 AGP1YCL025C 1902 nt10.68□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 ALG3YBL082C 1377 nt10.67□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 YIR016WYIR016W 798 nt10.66□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 RTG1YOL067C 534 nt10.66□□□□□ -0.7
TMA46Q12000 YPR064WYPR064W 420 nt10.64□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 HHO1YPL127C 777 nt10.6□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 MET8YBR213W 825 nt10.6□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 SWC5YBR231C 912 nt10.6□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 TAD3YLR316C 969 nt10.59□□□□□ -0.71
TMA46Q12000 PRP4YPR178W 1398 nt10.53□□□□□ -0.72
TMA46Q12000 DUS1YML080W 1272 nt10.53□□□□□ -0.72
TMA46Q12000 XDJ1YLR090W 1380 nt10.52□□□□□ -0.72
TMA46Q12000 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.52□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 YEL076CYEL076C 651 nt10.52□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 YLR464WYLR464W 651 nt10.52□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 DUT1YBR252W 444 nt10.52□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 BDH1YAL060W 1149 nt10.51□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 YGR201CYGR201C 678 nt10.49□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 YCL074WYCL074W 927 nt10.48□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 DPS1YLL018C 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 CSM2YIL132C 642 nt10.47□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 YKR005CYKR005C 1578 nt10.47□□□□□ -0.73
TMA46Q12000 CLB6YGR109C 1143 nt10.45□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.44□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.44□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.43□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 YLR415CYLR415C 339 nt10.42□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 GDH3YAL062W 1374 nt10.41□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 STR3YGL184C 1398 nt10.4□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 AVT6YER119C 1347 nt10.4□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 HUA1YGR268C 597 nt10.4□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 AAC1YMR056C 930 nt10.4□□□□□ -0.74
TMA46Q12000 YSP3YOR003W 1437 nt10.39□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 YGR259CYGR259C 441 nt10.37□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 SHM2YLR058C 1410 nt10.37□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 SNF1YDR477W 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 NAR1YNL240C 1476 nt10.36□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 BMT6YLR063W 1098 nt10.35□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 GOR1YNL274C 1053 nt10.35□□□□□ -0.75
TMA46Q12000 AQY2YLL052C 450 nt10.33□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 MRPL8YJL063C 717 nt10.32□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 BIO5YNR056C 1686 nt10.31□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 FRE6YLL051C 2139 nt10.3□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 NIT1YIL164C 600 nt10.29□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 TIM17YJL143W 477 nt10.28□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 YNL115CYNL115C 1935 nt10.27□□□□□ -0.76
TMA46Q12000 ADO1YJR105W 1023 nt10.27□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 PBP1YGR178C 2169 nt10.25□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 IRC24YIR036C 792 nt10.25□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 YFL066CYFL066C 1179 nt10.22□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 PEX25YPL112C 1185 nt10.22□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 YJR154WYJR154W 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 DAT1YML113W 747 nt10.21□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 SGT2YOR007C 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
TMA46Q12000 HSL7YBR133C 2484 nt10.21□□□□□ -0.78
TMA46Q12000 RPM1RPM1 483 nt10.2□□□□□ -0.78
TMA46Q12000 RTN2YDL204W 1182 nt10.17□□□□□ -0.78
TMA46Q12000 NBP35YGL091C 987 nt10.16□□□□□ -0.78
TMA46Q12000 CYT2YKL087C 675 nt10.15□□□□□ -0.78
TMA46Q12000 Q0010Q0010 387 nt10.14□□□□□ -0.79
TMA46Q12000 YCR102CYCR102C 1107 nt10.13□□□□□ -0.79
TMA46Q12000 VPS75YNL246W 795 nt10.11□□□□□ -0.79
TMA46Q12000 PRE6YOL038W 765 nt10.11□□□□□ -0.79
TMA46Q12000 YFR018CYFR018C 1092 nt10.1□□□□□ -0.79
TMA46Q12000 PLB1YMR008C 1995 nt10.09□□□□□ -0.79
TMA46Q12000 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.08□□□□□ -0.8
TMA46Q12000 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.08□□□□□ -0.8
TMA46Q12000 ARP6YLR085C 1317 nt10.07□□□□□ -0.8
TMA46Q12000 SHH4YLR164W 507 nt10.02□□□□□ -0.81
TMA46Q12000 CMP2YML057W 1815 nt10.02□□□□□ -0.81
TMA46Q12000 PAU21YOR394W 495 nt10□□□□□ -0.81
TMA46Q12000 PAU22YPL282C 495 nt10□□□□□ -0.81
TMA46Q12000 PRM5YIL117C 957 nt9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms