Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col19a1Q0VF58 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col19a1Q0VF58 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col19a1Q0VF58 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col19a1Q0VF58 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col19a1Q0VF58 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col19a1Q0VF58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col19a1Q0VF58 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col19a1Q0VF58 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col19a1Q0VF58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col19a1Q0VF58 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col19a1Q0VF58 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col19a1Q0VF58 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col19a1Q0VF58 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col19a1Q0VF58 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col19a1Q0VF58 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col19a1Q0VF58 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col19a1Q0VF58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col19a1Q0VF58 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col19a1Q0VF58 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col19a1Q0VF58 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col19a1Q0VF58 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col19a1Q0VF58 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col19a1Q0VF58 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col19a1Q0VF58 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col19a1Q0VF58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col19a1Q0VF58 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col19a1Q0VF58 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Col19a1Q0VF58 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col19a1Q0VF58 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col19a1Q0VF58 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col19a1Q0VF58 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col19a1Q0VF58 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col19a1Q0VF58 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col19a1Q0VF58 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col19a1Q0VF58 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col19a1Q0VF58 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col19a1Q0VF58 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col19a1Q0VF58 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Col19a1Q0VF58 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Col19a1Q0VF58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col19a1Q0VF58 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col19a1Q0VF58 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col19a1Q0VF58 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col19a1Q0VF58 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col19a1Q0VF58 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col19a1Q0VF58 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col19a1Q0VF58 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col19a1Q0VF58 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col19a1Q0VF58 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col19a1Q0VF58 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col19a1Q0VF58 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col19a1Q0VF58 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col19a1Q0VF58 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col19a1Q0VF58 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col19a1Q0VF58 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col19a1Q0VF58 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col19a1Q0VF58 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col19a1Q0VF58 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Col19a1Q0VF58 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col19a1Q0VF58 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col19a1Q0VF58 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col19a1Q0VF58 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col19a1Q0VF58 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col19a1Q0VF58 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col19a1Q0VF58 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col19a1Q0VF58 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col19a1Q0VF58 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms