Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D2

FAM69C, Protein FAM69C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69CQ0P6D2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
FAM69CQ0P6D2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
FAM69CQ0P6D2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
FAM69CQ0P6D2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
FAM69CQ0P6D2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
FAM69CQ0P6D2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
FAM69CQ0P6D2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
FAM69CQ0P6D2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
FAM69CQ0P6D2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
FAM69CQ0P6D2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
FAM69CQ0P6D2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
FAM69CQ0P6D2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
FAM69CQ0P6D2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
FAM69CQ0P6D2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
FAM69CQ0P6D2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
FAM69CQ0P6D2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
FAM69CQ0P6D2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
FAM69CQ0P6D2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
FAM69CQ0P6D2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.74■■■■■ 4.75
FAM69CQ0P6D2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
FAM69CQ0P6D2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
FAM69CQ0P6D2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
FAM69CQ0P6D2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
FAM69CQ0P6D2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
FAM69CQ0P6D2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
FAM69CQ0P6D2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
FAM69CQ0P6D2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
FAM69CQ0P6D2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
FAM69CQ0P6D2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
FAM69CQ0P6D2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
FAM69CQ0P6D2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
FAM69CQ0P6D2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
FAM69CQ0P6D2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
FAM69CQ0P6D2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
FAM69CQ0P6D2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
FAM69CQ0P6D2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
FAM69CQ0P6D2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
FAM69CQ0P6D2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
FAM69CQ0P6D2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
FAM69CQ0P6D2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
FAM69CQ0P6D2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
FAM69CQ0P6D2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC44.38■■■■■ 4.7
FAM69CQ0P6D2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
FAM69CQ0P6D2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
FAM69CQ0P6D2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
FAM69CQ0P6D2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
FAM69CQ0P6D2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44.26■■■■■ 4.68
FAM69CQ0P6D2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
FAM69CQ0P6D2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
FAM69CQ0P6D2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
FAM69CQ0P6D2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
FAM69CQ0P6D2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
FAM69CQ0P6D2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
FAM69CQ0P6D2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
FAM69CQ0P6D2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
FAM69CQ0P6D2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
FAM69CQ0P6D2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
FAM69CQ0P6D2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
FAM69CQ0P6D2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
FAM69CQ0P6D2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
FAM69CQ0P6D2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
FAM69CQ0P6D2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
FAM69CQ0P6D2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
FAM69CQ0P6D2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
FAM69CQ0P6D2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
FAM69CQ0P6D2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
FAM69CQ0P6D2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
FAM69CQ0P6D2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.85■■■■■ 4.61
FAM69CQ0P6D2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
FAM69CQ0P6D2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
FAM69CQ0P6D2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.81■■■■■ 4.6
FAM69CQ0P6D2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
FAM69CQ0P6D2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
FAM69CQ0P6D2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms