Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4F3Q08477 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4F3Q08477 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4F3Q08477 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP4F3Q08477 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4F3Q08477 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4F3Q08477 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4F3Q08477 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4F3Q08477 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4F3Q08477 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP4F3Q08477 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP4F3Q08477 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms