Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXM1Q08050 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXM1Q08050 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXM1Q08050 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXM1Q08050 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXM1Q08050 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXM1Q08050 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXM1Q08050 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXM1Q08050 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXM1Q08050 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXM1Q08050 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXM1Q08050 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXM1Q08050 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXM1Q08050 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXM1Q08050 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXM1Q08050 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXM1Q08050 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXM1Q08050 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXM1Q08050 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms