Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Col9a2Q07643 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col9a2Q07643 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col9a2Q07643 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col9a2Q07643 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col9a2Q07643 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Col9a2Q07643 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col9a2Q07643 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col9a2Q07643 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col9a2Q07643 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Col9a2Q07643 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col9a2Q07643 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col9a2Q07643 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col9a2Q07643 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col9a2Q07643 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col9a2Q07643 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col9a2Q07643 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col9a2Q07643 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col9a2Q07643 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col9a2Q07643 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col9a2Q07643 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col9a2Q07643 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col9a2Q07643 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col9a2Q07643 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col9a2Q07643 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col9a2Q07643 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col9a2Q07643 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col9a2Q07643 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col9a2Q07643 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col9a2Q07643 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col9a2Q07643 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Col9a2Q07643 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col9a2Q07643 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Col9a2Q07643 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col9a2Q07643 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Col9a2Q07643 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col9a2Q07643 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col9a2Q07643 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col9a2Q07643 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col9a2Q07643 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col9a2Q07643 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col9a2Q07643 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col9a2Q07643 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col9a2Q07643 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col9a2Q07643 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col9a2Q07643 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms