Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF9Q07011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF9Q07011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF9Q07011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF9Q07011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF9Q07011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF9Q07011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF9Q07011 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF9Q07011 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF9Q07011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF9Q07011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF9Q07011 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF9Q07011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF9Q07011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF9Q07011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms