Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNG1Q06432 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNG1Q06432 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNG1Q06432 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNG1Q06432 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNG1Q06432 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNG1Q06432 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNG1Q06432 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNG1Q06432 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNG1Q06432 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CACNG1Q06432 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CACNG1Q06432 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNG1Q06432 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNG1Q06432 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNG1Q06432 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNG1Q06432 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNG1Q06432 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNG1Q06432 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG1Q06432 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG1Q06432 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG1Q06432 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNG1Q06432 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG1Q06432 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNG1Q06432 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNG1Q06432 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNG1Q06432 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG1Q06432 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNG1Q06432 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNG1Q06432 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG1Q06432 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG1Q06432 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNG1Q06432 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNG1Q06432 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNG1Q06432 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG1Q06432 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNG1Q06432 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNG1Q06432 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG1Q06432 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNG1Q06432 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms