Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNEQ04844 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNEQ04844 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNEQ04844 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNEQ04844 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNEQ04844 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNEQ04844 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNEQ04844 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNEQ04844 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNEQ04844 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNEQ04844 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNEQ04844 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNEQ04844 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNEQ04844 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNEQ04844 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms