Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKCQQ04759 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCQQ04759 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCQQ04759 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCQQ04759 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCQQ04759 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCQQ04759 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCQQ04759 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCQQ04759 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCQQ04759 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCQQ04759 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCQQ04759 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCQQ04759 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCQQ04759 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCQQ04759 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKCQQ04759 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCQQ04759 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms