Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nf1Q04690 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nf1Q04690 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nf1Q04690 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nf1Q04690 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nf1Q04690 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nf1Q04690 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nf1Q04690 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nf1Q04690 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nf1Q04690 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nf1Q04690 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nf1Q04690 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nf1Q04690 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nf1Q04690 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nf1Q04690 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nf1Q04690 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nf1Q04690 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nf1Q04690 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nf1Q04690 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nf1Q04690 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nf1Q04690 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nf1Q04690 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nf1Q04690 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nf1Q04690 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nf1Q04690 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nf1Q04690 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nf1Q04690 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nf1Q04690 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nf1Q04690 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nf1Q04690 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nf1Q04690 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nf1Q04690 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nf1Q04690 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nf1Q04690 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nf1Q04690 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nf1Q04690 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nf1Q04690 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nf1Q04690 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nf1Q04690 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nf1Q04690 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nf1Q04690 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nf1Q04690 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nf1Q04690 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nf1Q04690 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nf1Q04690 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nf1Q04690 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nf1Q04690 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nf1Q04690 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nf1Q04690 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nf1Q04690 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms