Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YNL115CYNL115C 1935 nt13.01□□□□□ -0.33
UBX2Q04228 RRT12YCR045C 1476 nt12.99□□□□□ -0.33
UBX2Q04228 BDH1YAL060W 1149 nt12.99□□□□□ -0.33
UBX2Q04228 YSP3YOR003W 1437 nt12.98□□□□□ -0.33
UBX2Q04228 STB1YNL309W 1263 nt12.96□□□□□ -0.33
UBX2Q04228 TRM5YHR070W 1500 nt12.96□□□□□ -0.33
UBX2Q04228 CCT4YDL143W 1587 nt12.92□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 MSF1YPR047W 1410 nt12.92□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 SWC5YBR231C 912 nt12.92□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 GPI16YHR188C 1833 nt12.91□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 SPC25YER018C 666 nt12.91□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 DDR2YOL052C-A 186 nt12.91□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.9□□□□□ -0.34
UBX2Q04228 THI74YDR438W 1113 nt12.89□□□□□ -0.35
UBX2Q04228 YFL067WYFL067W 528 nt12.86□□□□□ -0.35
UBX2Q04228 VPS75YNL246W 795 nt12.85□□□□□ -0.35
UBX2Q04228 MIR1YJR077C 936 nt12.84□□□□□ -0.35
UBX2Q04228 ERF2YLR246W 1080 nt12.84□□□□□ -0.35
UBX2Q04228 YHL050CYHL050C 2094 nt12.82□□□□□ -0.36
UBX2Q04228 VPS60YDR486C 690 nt12.82□□□□□ -0.36
UBX2Q04228 ATF2YGR177C 1608 nt12.8□□□□□ -0.36
UBX2Q04228 PAU7YAR020C 168 nt12.78□□□□□ -0.36
UBX2Q04228 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.77□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 FEN2YCR028C 1539 nt12.73□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 ALG3YBL082C 1377 nt12.73□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 CRR1YLR213C 1269 nt12.72□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 PCH2YBR186W 1695 nt12.72□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 SPT8YLR055C 1809 nt12.72□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 SEC11YIR022W 504 nt12.71□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 YMR244WYMR244W 1068 nt12.71□□□□□ -0.37
UBX2Q04228 DAT1YML113W 747 nt12.69□□□□□ -0.38
UBX2Q04228 GUT2YIL155C 1950 nt12.68□□□□□ -0.38
UBX2Q04228 ANP1YEL036C 1503 nt12.67□□□□□ -0.38
UBX2Q04228 TIM17YJL143W 477 nt12.67□□□□□ -0.38
UBX2Q04228 GLR1YPL091W 1452 nt12.66□□□□□ -0.38
UBX2Q04228 HEM12YDR047W 1089 nt12.64□□□□□ -0.39
UBX2Q04228 YGL034CYGL034C 366 nt12.62□□□□□ -0.39
UBX2Q04228 SNG1YGR197C 1644 nt12.62□□□□□ -0.39
UBX2Q04228 YIR016WYIR016W 798 nt12.6□□□□□ -0.39
UBX2Q04228 UBA4YHR111W 1323 nt12.6□□□□□ -0.39
UBX2Q04228 YSR3YKR053C 1215 nt12.58□□□□□ -0.4
UBX2Q04228 SHB17YKR043C 816 nt12.55□□□□□ -0.4
UBX2Q04228 NDI1YML120C 1542 nt12.55□□□□□ -0.4
UBX2Q04228 MIC10YCL057C-A 294 nt12.54□□□□□ -0.4
UBX2Q04228 RBG2YGR173W 1107 nt12.5□□□□□ -0.41
UBX2Q04228 PIB2YGL023C 1908 nt12.5□□□□□ -0.41
UBX2Q04228 SHM2YLR058C 1410 nt12.49□□□□□ -0.41
UBX2Q04228 RBG1YAL036C 1110 nt12.49□□□□□ -0.41
UBX2Q04228 BNA2YJR078W 1362 nt12.47□□□□□ -0.41
UBX2Q04228 XYL2YLR070C 1071 nt12.47□□□□□ -0.41
UBX2Q04228 XDJ1YLR090W 1380 nt12.45□□□□□ -0.42
UBX2Q04228 YCR087WYCR087W 516 nt12.45□□□□□ -0.42
UBX2Q04228 LYS4YDR234W 2082 nt12.42□□□□□ -0.42
UBX2Q04228 NCP1YHR042W 2076 nt12.42□□□□□ -0.42
UBX2Q04228 SGT2YOR007C 1041 nt12.41□□□□□ -0.42
UBX2Q04228 BOP3YNL042W 1191 nt12.4□□□□□ -0.42
UBX2Q04228 PHO89YBR296C 1725 nt12.4□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 RTF1YGL244W 1677 nt12.38□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 YDR010CYDR010C 333 nt12.38□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 GDH3YAL062W 1374 nt12.36□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 RET2YFR051C 1641 nt12.36□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 AIM45YPR004C 1035 nt12.35□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 YMR226CYMR226C 804 nt12.34□□□□□ -0.43
UBX2Q04228 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.32□□□□□ -0.44
UBX2Q04228 NIT1YIL164C 600 nt12.32□□□□□ -0.44
UBX2Q04228 MIC12YBR262C 321 nt12.3□□□□□ -0.44
UBX2Q04228 MRP20YDR405W 792 nt12.29□□□□□ -0.44
UBX2Q04228 RAX1YOR301W 1308 nt12.28□□□□□ -0.44
UBX2Q04228 YGR201CYGR201C 678 nt12.27□□□□□ -0.45
UBX2Q04228 HHO1YPL127C 777 nt12.27□□□□□ -0.45
UBX2Q04228 YLR111WYLR111W 333 nt12.23□□□□□ -0.45
UBX2Q04228 AVT6YER119C 1347 nt12.22□□□□□ -0.45
UBX2Q04228 PTK1YKL198C 1989 nt12.22□□□□□ -0.45
UBX2Q04228 UME6YDR207C 2511 nt12.21□□□□□ -0.45
UBX2Q04228 SAM1YLR180W 1149 nt12.19□□□□□ -0.46
UBX2Q04228 GOR1YNL274C 1053 nt12.16□□□□□ -0.46
UBX2Q04228 COQ2YNR041C 1119 nt12.16□□□□□ -0.46
UBX2Q04228 YCR102CYCR102C 1107 nt12.11□□□□□ -0.47
UBX2Q04228 SDH5YOL071W 489 nt12.11□□□□□ -0.47
UBX2Q04228 RPL4BYDR012W 1089 nt12.07□□□□□ -0.48
UBX2Q04228 CLB6YGR109C 1143 nt12.07□□□□□ -0.48
UBX2Q04228 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.07□□□□□ -0.48
UBX2Q04228 RPL4AYBR031W 1089 nt12.07□□□□□ -0.48
UBX2Q04228 SFA1YDL168W 1161 nt12.04□□□□□ -0.48
UBX2Q04228 YFL054CYFL054C 1941 nt11.99□□□□□ -0.49
UBX2Q04228 RAD23YEL037C 1197 nt11.97□□□□□ -0.49
UBX2Q04228 UTH1YKR042W 1098 nt11.96□□□□□ -0.49
UBX2Q04228 BOR1YNL275W 1731 nt11.96□□□□□ -0.49
UBX2Q04228 RPS14BYJL191W 417 nt11.95□□□□□ -0.5
UBX2Q04228 YJL225CYJL225C 5277 nt11.95□□□□□ -0.5
UBX2Q04228 DUT1YBR252W 444 nt11.92□□□□□ -0.5
UBX2Q04228 TIR3YIL011W 810 nt11.9□□□□□ -0.5
UBX2Q04228 TSC10YBR265W 963 nt11.89□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 AGP1YCL025C 1902 nt11.88□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 CCA1YER168C 1641 nt11.88□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 RAD51YER095W 1203 nt11.86□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 TOM6YOR045W 186 nt11.86□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 NBP35YGL091C 987 nt11.84□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 YGR012WYGR012W 1182 nt11.84□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 PEX2YJL210W 816 nt11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms