Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID5AQ03989 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID5AQ03989 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID5AQ03989 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID5AQ03989 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID5AQ03989 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID5AQ03989 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID5AQ03989 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID5AQ03989 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID5AQ03989 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID5AQ03989 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID5AQ03989 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID5AQ03989 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID5AQ03989 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID5AQ03989 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID5AQ03989 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID5AQ03989 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID5AQ03989 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID5AQ03989 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARID5AQ03989 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID5AQ03989 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID5AQ03989 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID5AQ03989 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID5AQ03989 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID5AQ03989 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID5AQ03989 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID5AQ03989 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID5AQ03989 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID5AQ03989 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID5AQ03989 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms