Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFHR1Q03591 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFHR1Q03591 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHR1Q03591 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFHR1Q03591 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFHR1Q03591 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFHR1Q03591 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFHR1Q03591 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFHR1Q03591 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFHR1Q03591 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFHR1Q03591 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFHR1Q03591 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHR1Q03591 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFHR1Q03591 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFHR1Q03591 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFHR1Q03591 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFHR1Q03591 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CFHR1Q03591 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFHR1Q03591 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFHR1Q03591 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFHR1Q03591 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFHR1Q03591 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CFHR1Q03591 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFHR1Q03591 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFHR1Q03591 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFHR1Q03591 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFHR1Q03591 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFHR1Q03591 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFHR1Q03591 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CFHR1Q03591 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms