Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 SPC25YER018C 666 nt11.28□□□□□ -0.6
GCN5Q03330 YFL066CYFL066C 1179 nt11.28□□□□□ -0.6
GCN5Q03330 YSP3YOR003W 1437 nt11.26□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 STB1YNL309W 1263 nt11.26□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 PEX25YPL112C 1185 nt11.26□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 ATF2YGR177C 1608 nt11.26□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 ERF2YLR246W 1080 nt11.23□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 CCT4YDL143W 1587 nt11.23□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 PCH2YBR186W 1695 nt11.23□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 YFL067WYFL067W 528 nt11.22□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 NCP1YHR042W 2076 nt11.21□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 YLR415CYLR415C 339 nt11.21□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 DDR2YOL052C-A 186 nt11.21□□□□□ -0.61
GCN5Q03330 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.2□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 SBA1YKL117W 651 nt11.2□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 YNL115CYNL115C 1935 nt11.19□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 CRR1YLR213C 1269 nt11.19□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 GPI16YHR188C 1833 nt11.19□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.17□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 GUT2YIL155C 1950 nt11.16□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 VPS60YDR486C 690 nt11.16□□□□□ -0.62
GCN5Q03330 ANP1YEL036C 1503 nt11.13□□□□□ -0.63
GCN5Q03330 LYS4YDR234W 2082 nt11.12□□□□□ -0.63
GCN5Q03330 FEN2YCR028C 1539 nt11.12□□□□□ -0.63
GCN5Q03330 ALG3YBL082C 1377 nt11.12□□□□□ -0.63
GCN5Q03330 SWC5YBR231C 912 nt11.11□□□□□ -0.63
GCN5Q03330 SNG1YGR197C 1644 nt11.09□□□□□ -0.63
GCN5Q03330 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 NAT4YMR069W 858 nt11.07□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 HEM12YDR047W 1089 nt11.06□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 BOP3YNL042W 1191 nt11.06□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 VPS75YNL246W 795 nt11.05□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 MIC10YCL057C-A 294 nt11.05□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 PIB2YGL023C 1908 nt11.05□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 SPT8YLR055C 1809 nt11.03□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 RTF1YGL244W 1677 nt11.03□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 GLK1YCL040W 1503 nt11.03□□□□□ -0.64
GCN5Q03330 YIR016WYIR016W 798 nt11.02□□□□□ -0.65
GCN5Q03330 MIR1YJR077C 936 nt11.02□□□□□ -0.65
GCN5Q03330 MSF1YPR047W 1410 nt10.99□□□□□ -0.65
GCN5Q03330 THI74YDR438W 1113 nt10.97□□□□□ -0.65
GCN5Q03330 PTK1YKL198C 1989 nt10.89□□□□□ -0.67
GCN5Q03330 TIM17YJL143W 477 nt10.89□□□□□ -0.67
GCN5Q03330 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.87□□□□□ -0.67
GCN5Q03330 DAT1YML113W 747 nt10.86□□□□□ -0.67
GCN5Q03330 SHM2YLR058C 1410 nt10.85□□□□□ -0.67
GCN5Q03330 MIC12YBR262C 321 nt10.85□□□□□ -0.67
GCN5Q03330 PAU7YAR020C 168 nt10.83□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 YJL225CYJL225C 5277 nt10.83□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 XDJ1YLR090W 1380 nt10.82□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 BNA2YJR078W 1362 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 UBA4YHR111W 1323 nt10.81□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 NIT1YIL164C 600 nt10.79□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 RAX1YOR301W 1308 nt10.79□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 SHB17YKR043C 816 nt10.78□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 BOR1YNL275W 1731 nt10.78□□□□□ -0.68
GCN5Q03330 YGL034CYGL034C 366 nt10.77□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 YMR244WYMR244W 1068 nt10.76□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 YDR010CYDR010C 333 nt10.75□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 SGT2YOR007C 1041 nt10.75□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 GDH3YAL062W 1374 nt10.75□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 YGR201CYGR201C 678 nt10.72□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 YSR3YKR053C 1215 nt10.71□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 HHO1YPL127C 777 nt10.71□□□□□ -0.69
GCN5Q03330 YFL054CYFL054C 1941 nt10.69□□□□□ -0.7
GCN5Q03330 GLR1YPL091W 1452 nt10.68□□□□□ -0.7
GCN5Q03330 XYL2YLR070C 1071 nt10.67□□□□□ -0.7
GCN5Q03330 RET2YFR051C 1641 nt10.66□□□□□ -0.7
GCN5Q03330 MCH5YOR306C 1566 nt10.64□□□□□ -0.71
GCN5Q03330 NDI1YML120C 1542 nt10.63□□□□□ -0.71
GCN5Q03330 PHO89YBR296C 1725 nt10.61□□□□□ -0.71
GCN5Q03330 AVT6YER119C 1347 nt10.61□□□□□ -0.71
GCN5Q03330 RBG1YAL036C 1110 nt10.6□□□□□ -0.71
GCN5Q03330 YCR087WYCR087W 516 nt10.59□□□□□ -0.71
GCN5Q03330 AGP1YCL025C 1902 nt10.57□□□□□ -0.72
GCN5Q03330 GOR1YNL274C 1053 nt10.56□□□□□ -0.72
GCN5Q03330 AIM45YPR004C 1035 nt10.56□□□□□ -0.72
GCN5Q03330 RBG2YGR173W 1107 nt10.55□□□□□ -0.72
GCN5Q03330 CCA1YER168C 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
GCN5Q03330 DUT1YBR252W 444 nt10.54□□□□□ -0.72
GCN5Q03330 YCR102CYCR102C 1107 nt10.52□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.52□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.52□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 YGR139WYGR139W 339 nt10.51□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 COQ2YNR041C 1119 nt10.51□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 SFA1YDL168W 1161 nt10.5□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 SWE1YJL187C 2460 nt10.49□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 MRP20YDR405W 792 nt10.48□□□□□ -0.73
GCN5Q03330 YMR226CYMR226C 804 nt10.44□□□□□ -0.74
GCN5Q03330 NBP35YGL091C 987 nt10.42□□□□□ -0.74
GCN5Q03330 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.41□□□□□ -0.74
GCN5Q03330 SHH4YLR164W 507 nt10.38□□□□□ -0.75
GCN5Q03330 ALG12YNR030W 1656 nt10.38□□□□□ -0.75
GCN5Q03330 RPL4BYDR012W 1089 nt10.37□□□□□ -0.75
GCN5Q03330 TIR3YIL011W 810 nt10.37□□□□□ -0.75
GCN5Q03330 RPL4AYBR031W 1089 nt10.37□□□□□ -0.75
GCN5Q03330 RPS14BYJL191W 417 nt10.33□□□□□ -0.76
GCN5Q03330 NME1NME1 340 nt10.33□□□□□ -0.76
GCN5Q03330 STR3YGL184C 1398 nt10.33□□□□□ -0.76
GCN5Q03330 CLB6YGR109C 1143 nt10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms