Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP2Q03169 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP2Q03169 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP2Q03169 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP2Q03169 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNFAIP2Q03169 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNFAIP2Q03169 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNFAIP2Q03169 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP2Q03169 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNFAIP2Q03169 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNFAIP2Q03169 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TNFAIP2Q03169 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNFAIP2Q03169 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNFAIP2Q03169 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNFAIP2Q03169 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNFAIP2Q03169 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNFAIP2Q03169 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNFAIP2Q03169 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNFAIP2Q03169 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNFAIP2Q03169 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TNFAIP2Q03169 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNFAIP2Q03169 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNFAIP2Q03169 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TNFAIP2Q03169 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
TNFAIP2Q03169 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNFAIP2Q03169 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNFAIP2Q03169 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TNFAIP2Q03169 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNFAIP2Q03169 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNFAIP2Q03169 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNFAIP2Q03169 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TNFAIP2Q03169 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNFAIP2Q03169 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNFAIP2Q03169 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNFAIP2Q03169 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNFAIP2Q03169 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms