Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddr1Q03146 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddr1Q03146 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddr1Q03146 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddr1Q03146 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddr1Q03146 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ddr1Q03146 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ddr1Q03146 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddr1Q03146 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddr1Q03146 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddr1Q03146 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddr1Q03146 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddr1Q03146 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddr1Q03146 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddr1Q03146 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddr1Q03146 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddr1Q03146 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddr1Q03146 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ddr1Q03146 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddr1Q03146 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddr1Q03146 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddr1Q03146 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddr1Q03146 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddr1Q03146 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddr1Q03146 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddr1Q03146 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddr1Q03146 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddr1Q03146 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddr1Q03146 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddr1Q03146 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddr1Q03146 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddr1Q03146 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddr1Q03146 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddr1Q03146 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddr1Q03146 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddr1Q03146 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddr1Q03146 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ddr1Q03146 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddr1Q03146 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddr1Q03146 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ddr1Q03146 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddr1Q03146 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ddr1Q03146 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddr1Q03146 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddr1Q03146 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms