Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epha4Q03137 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epha4Q03137 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epha4Q03137 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha4Q03137 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epha4Q03137 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epha4Q03137 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epha4Q03137 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epha4Q03137 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epha4Q03137 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epha4Q03137 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Epha4Q03137 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Epha4Q03137 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epha4Q03137 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epha4Q03137 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epha4Q03137 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epha4Q03137 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epha4Q03137 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epha4Q03137 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epha4Q03137 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epha4Q03137 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epha4Q03137 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epha4Q03137 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Epha4Q03137 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Epha4Q03137 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Epha4Q03137 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epha4Q03137 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Epha4Q03137 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epha4Q03137 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epha4Q03137 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Epha4Q03137 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Epha4Q03137 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Epha4Q03137 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha4Q03137 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Epha4Q03137 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epha4Q03137 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha4Q03137 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Epha4Q03137 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epha4Q03137 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Epha4Q03137 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Epha4Q03137 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Epha4Q03137 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epha4Q03137 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epha4Q03137 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epha4Q03137 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epha4Q03137 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epha4Q03137 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms