Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHODHQ02127 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHODHQ02127 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHODHQ02127 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHODHQ02127 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHODHQ02127 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHODHQ02127 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHODHQ02127 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHODHQ02127 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DHODHQ02127 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHODHQ02127 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHODHQ02127 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHODHQ02127 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms