Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALK2Q01415 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALK2Q01415 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALK2Q01415 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALK2Q01415 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GALK2Q01415 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALK2Q01415 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALK2Q01415 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALK2Q01415 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALK2Q01415 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms