Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apoa1Q00623 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apoa1Q00623 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apoa1Q00623 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apoa1Q00623 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apoa1Q00623 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apoa1Q00623 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apoa1Q00623 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apoa1Q00623 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apoa1Q00623 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apoa1Q00623 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Apoa1Q00623 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoa1Q00623 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoa1Q00623 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apoa1Q00623 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Apoa1Q00623 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoa1Q00623 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apoa1Q00623 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoa1Q00623 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Apoa1Q00623 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apoa1Q00623 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa1Q00623 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms