Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK16Q00536 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK16Q00536 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK16Q00536 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK16Q00536 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK16Q00536 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK16Q00536 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK16Q00536 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK16Q00536 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK16Q00536 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK16Q00536 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK16Q00536 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK16Q00536 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK16Q00536 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK16Q00536 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK16Q00536 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK16Q00536 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK16Q00536 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK16Q00536 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK16Q00536 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK16Q00536 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK16Q00536 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK16Q00536 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK16Q00536 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK16Q00536 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK16Q00536 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK16Q00536 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK16Q00536 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK16Q00536 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms