Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP11AP98196 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP11AP98196 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP11AP98196 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP11AP98196 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP11AP98196 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP11AP98196 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP11AP98196 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP11AP98196 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP11AP98196 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP11AP98196 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP11AP98196 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP11AP98196 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP11AP98196 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP11AP98196 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP11AP98196 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP11AP98196 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP11AP98196 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP11AP98196 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP11AP98196 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP11AP98196 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11AP98196 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11AP98196 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP11AP98196 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms