Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3AP98173 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM3AP98173 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM3AP98173 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM3AP98173 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM3AP98173 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM3AP98173 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM3AP98173 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3AP98173 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3AP98173 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms