Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VegfcP97953 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VegfcP97953 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VegfcP97953 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VegfcP97953 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VegfcP97953 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VegfcP97953 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VegfcP97953 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VegfcP97953 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VegfcP97953 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VegfcP97953 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VegfcP97953 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VegfcP97953 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VegfcP97953 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VegfcP97953 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VegfcP97953 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VegfcP97953 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VegfcP97953 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VegfcP97953 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VegfcP97953 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VegfcP97953 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VegfcP97953 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VegfcP97953 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VegfcP97953 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VegfcP97953 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VegfcP97953 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VegfcP97953 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VegfcP97953 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VegfcP97953 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VegfcP97953 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfcP97953 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfcP97953 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VegfcP97953 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VegfcP97953 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VegfcP97953 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VegfcP97953 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VegfcP97953 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VegfcP97953 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VegfcP97953 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfcP97953 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VegfcP97953 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VegfcP97953 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VegfcP97953 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VegfcP97953 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfcP97953 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VegfcP97953 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VegfcP97953 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VegfcP97953 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VegfcP97953 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VegfcP97953 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VegfcP97953 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VegfcP97953 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VegfcP97953 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VegfcP97953 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VegfcP97953 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfcP97953 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VegfcP97953 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VegfcP97953 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VegfcP97953 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VegfcP97953 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VegfcP97953 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VegfcP97953 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VegfcP97953 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VegfcP97953 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VegfcP97953 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfcP97953 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VegfcP97953 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VegfcP97953 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms