Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lig3P97386 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lig3P97386 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lig3P97386 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lig3P97386 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lig3P97386 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lig3P97386 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lig3P97386 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lig3P97386 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lig3P97386 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lig3P97386 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lig3P97386 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lig3P97386 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lig3P97386 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lig3P97386 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lig3P97386 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lig3P97386 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lig3P97386 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lig3P97386 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lig3P97386 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lig3P97386 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lig3P97386 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lig3P97386 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lig3P97386 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lig3P97386 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lig3P97386 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lig3P97386 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lig3P97386 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lig3P97386 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lig3P97386 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lig3P97386 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lig3P97386 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lig3P97386 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lig3P97386 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lig3P97386 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lig3P97386 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lig3P97386 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lig3P97386 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lig3P97386 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lig3P97386 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lig3P97386 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lig3P97386 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lig3P97386 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lig3P97386 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lig3P97386 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lig3P97386 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lig3P97386 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lig3P97386 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lig3P97386 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lig3P97386 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lig3P97386 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lig3P97386 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lig3P97386 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lig3P97386 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig3P97386 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 942 ms