Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HpcaP84075 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HpcaP84075 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HpcaP84075 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HpcaP84075 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HpcaP84075 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpcaP84075 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HpcaP84075 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HpcaP84075 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HpcaP84075 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HpcaP84075 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HpcaP84075 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HpcaP84075 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HpcaP84075 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HpcaP84075 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HpcaP84075 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HpcaP84075 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HpcaP84075 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HpcaP84075 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HpcaP84075 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpcaP84075 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HpcaP84075 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HpcaP84075 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HpcaP84075 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HpcaP84075 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpcaP84075 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms