Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IL13RA1P78552 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IL13RA1P78552 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IL13RA1P78552 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IL13RA1P78552 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IL13RA1P78552 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IL13RA1P78552 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IL13RA1P78552 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IL13RA1P78552 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IL13RA1P78552 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IL13RA1P78552 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL13RA1P78552 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL13RA1P78552 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL13RA1P78552 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL13RA1P78552 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL13RA1P78552 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IL13RA1P78552 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms