Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx4P70452 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stx4P70452 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx4P70452 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx4P70452 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx4P70452 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx4P70452 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx4P70452 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx4P70452 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx4P70452 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx4P70452 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx4P70452 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx4P70452 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx4P70452 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms